Gerçek sitrin taşı, doğal olarak dünya genelinde birçok farklı yerde oluşabilir. Sitrin, kuvars minerali ailesinin bir üyesidir ve genellikle diğer kuvars kristalleriyle birlikte bulunur.
Sitrin taşı, genellikle magmatik kayaların içinde veya magmanın soğuması ve kristalleşmesi sırasında oluşan kuvars damarlarında bulunur. Ayrıca, hidrotermal kayaların ve kaynak sularının etkileşimiyle oluşan kuvars damarlarında da sitrin taşı oluşabilir. Sitrin, bu süreçlerde demir minerali varlığı nedeniyle renklenir ve güneş ışığı altında parlak bir ışıltı gösterir.
Doğal sitrin taşları, genellikle soluk sarı veya kahverengi renklidir ancak daha yoğun renklerde de olabilirler. Sitrin taşı, doğal olarak oluştuğu şekliyle mücevherlerde kullanılır veya daha az değerli ısıtılmış sitrin taşı gibi yapay işlemlere tabi tutularak renkleri arttırılabilir.